תחום המחלות זיהומיות מערב את כל התחומים ברפואה. מחלות קהילתיות שנחשבות בנאליות כמו: חום וכאבי גרון, חיסונים, זיהומים הנרכשים בחו"ל (מחלות טרופיות בעיקר), מחלות מין, מניעת זיהומים לפני ניתוחים וזיהומים שנרכשים בעקבות ניתוח. במקרים רבים המומחה למחלות זיהומיות מפנה מטופל לכירורג כאשר הטיפול הוא כירורגי ובמקרים אחרים הכירורג פונה למומחה למחלות זיהומיות על מנת להתאים טיפול אנטיביוטי.