שחזור מערכת העיכול הוא ניתוח מורכב שמטרתו לבנות מחדש את האנטומיה התקינה או ליצור מעקפים למזון לאחר כריתה (בשל סרטן/דלקת), ניתוחים בריאטריים (שרוול/מעקף) או סגירת סטומה. הפרוצדורה משתנה בהתאם לאיבר (ושט, קיבה, מעי) ומבוצעת לרוב בגישה לפרוסקופית לשיפור ההחלמה